Patriarhul Justinian Marina este considerat unul dintre ctitorii reprezentativi ai Bibliotecii Seminarului, întrucât a susținut permanent necesitatea existenței acesteia, atât în primi ani ai păstoririi Sale, când biblioteca trecea prin mari greutăți, cât și după anul 1971, când aceasta se restabilește în proximitatea Internatului de la Radu Vodă.

            Grija arătată de Preafericirea Sa Bibliotecii, s-a manifestat prin repetate inițiative de îmbogățire a colecțiilor din diferite surse, prin donații personale, cât și prin direcționarea aparițiilor editoriale de la tipografiile Patriarhiei Române.

            O mărturie deosebită pentru interesul Patriarhului față de Biblioteca Seminarului din București, este testamentul Preafericii Sale, în care menționează: 

Bibliotecii Seminarului, pe lângă colecția revistelor și tipăriturilor din Editura Institutului Biblic și cărți din literatura română – în total volume de peste 3.000, i se vor adăuga cărțile și revistele în limba română ce se vor găsi la moartea mea.

Totodată, în testamentul său din 7 martie 1976, lasă îndemnuri prețioase și sfaturi pentru organizarea și păstrarea bibliotecilor teologice. Astfel, notează următoarele:

Pentru formarea clerului am organizat șapte Seminarii teologice cu o capacitate de peste [400] 300 de elevi / fiecare Seminar și două Institute de grad Universitar cu o capacitate de peste 600 de studenți pe an de fiecare. [...] Au la dispoziție în București cele patru (4) biblioteci cu zeci de mii de opere teologice, filozofice, științifice etc. ai căror bibliotecari stau la dispoziție.

Las urmașilor mei aceste patru Biblioteci cu sfatul de a păstra în întregime fondul actual și de a continua procurarea de noi cărți și de a păstra în bune condiții de funcționare localurile Seminariilor și Institutelor Teologice Universitare.

Biblioteca Seminarului a primit în data de 7 decembrie 1977, un număr de 147 de volume de cărți, donate prin Testament de Fericitul întru pomenire Patriarh Justinian Marina, care au fost catalogate și inventariate.

Un catalog important din arhiva Bibliotecii Seminarului, este fototeca ce conține imagini inedite cu Patriarhul Justinian Marina din timpul vizitelor efectuate la Biserica Mănăstirii Radu Vodă și Internatul Seminarului.

De asemenea, de o importanță deosebită pentru Biblioteca instituției, este un tablou inedit cu Patriarhul Justinian Marina, pictat de Stan Hermeneanu, care se află în grija Bibliotecii Seminarului de multă vreme.

Colecția Justinian Patriarhul conține totodată, memorabile semnături și dedicații de la mari personalități ale culturii și spiritualității românești.