Această colecție, mutată în 2007 în noua clădire a Seminarului, a fost aranjată alfabetic și tematic, conform normelor biblioteconomice. De-a lungul vremii, a fost îmbogățită datorită sprijinului mai multor donatori, dintre care amintim: Patriarhii Bisericii Ortodoxe Române Justinian Marina, Teoctist Arăpașu și Daniel Ciobotea, Preasfințitul Roman Ialomițeanul, Episcop vicar al Arhiepiscopiei Bucureștilor, Preasfințitul Timotei Prahoveanul, Episcop vicar al Arhiepiscopiei Bucureștilor, Arhim. Maxim Mereanu, Pr. Icon. Constantin Nazarie, Pr. Victor N. Popescu, Pr. Constantin Pârvu, Pr. Prof. Anatolie Zarea, profesori de la Facultatea de Teologie din București și de la Seminarul Teologic, Academia Română, Biblioteca Centrală Universitară Carol I, Biblioteca Sfântului Sinod, Institutul Pedagogic din București, viețuitori ai Mănăstirii Radu Vodă și bibliotecarii Seminarului.

În prezent, prin purtarea de grijă a Preafericitului Părinte Daniel, Patriarhul Bisericii Ortodoxe Române, se continuă tradiția lăsată de Patriarhul Iustinian, de a fi oferite bibliotecii, în mod gratuit, câte un exemplar din fiecare apariție editorială de la tipografiile Arhiepiscopiei Bucureștilor și Patriarhiei Române.

Fondul cuprinde, pe lângă numeroasele lucrări de teologie, și volume de literatură română și universală, filosofie, istorie, medicină, antologii, enciclopedii, dicționare, bibliografii, monografii, manuale, teze de doctorat, ș.a., multe dintre ele cu semnături și dedicații.

Colecția principală cuprinde circa 20.000 de unități, organizate pe domenii, după cum urmează:

v Teologie, cu domeniile: biblică, biografie, cult, dogmatică, drept, istoria Bisericii Ortodoxe Române și Universale, istoria religiilor, liturgică, misiologie, monografii, morală, muzică, omiletică, pastorală, patrologie, aghiografie și spiritualitate;

v Artă, cu domeniile: albume, antologie, biografie, civilizație, eseuri, estetică, gândire, istorie, memorii, pictură, religioasă, românească, varia;

v Dicționare, cu domeniile: americană, antonime, arhaisme, artă, biografie, bulgară, cinema, critică, ebraică, enciclopedie, engleză, filosofie, franceză, germană, greacă, istorie, italiană, latină, literar, logică, maghiară, mitologie, muzică, neologisme, omonime, ortografic, paronime, pedagogie, persană, pleonasm, politică, poloneză, portugheză, regionalisme, religie, română, rusă, sinonime, spaniolă, teologie, ucraineană, varia;

v Filosofie, cu domeniile: creștină, germană, greacă, istorie, română, studii, universală, varia;

v Istorie, cu domeniile: biografii, monografie, muzică, românilor, secretă, universală;

v Literatură, cu domeniile: aforisme, agronomie, albume, alpinism, amintiri, antologie, arheologie, arhitectură, artă, articole, astronomie, balade, basm, bibliografie, biblioteconomie, biografie, cazanii, călătorie, civilizație, comedii, comentarii, comunicare, corespondență, cosmos, creștină, critică, cronici, cugetări, culegere, cultură, curent, cursuri, dicționare, documentar, documente, doine, drept, elegii, enciclopedie, epigrame, epistole, epopee, eseuri, estetică, etnologie, evocări, fabule, film, filosofie, folclor, ghicitori, grafologie, gramatică, hinduism, idealuri, interviu, invenții, istorie, iudaism, învățătură, judiciar, jurnal, lectură, legende, legi, lexicon, lingvistic, literar, logică, maniere, manuscrise, matematică, maxime, mărturii, medalioane, medicină, meditații, memorii, miracole, mitologie, monografie, morală, muzică, naval, nuvele, oratorie, pamflete, parodii, pedagogie, pictură, poem, poetică, poezie, politică, portrete, povestiri, predici, proverb, proză, psihologie, publicistică, răzlețe, recenzii, recviem, religie, retorică, roman, saturnalii, schițe, science-fiction, sinteze, sociologie, sonete, stilistică, studii, teatru, teste, tipar, traducere, turism, umanism, umor, universală, urban, varia;

v Literatură universală, cu domeniile: aforisme, albaneză, americană, antologie, arabă, armeană, bulgară, cehă, chineză, comentarii, critică, cubaneză, daneză, dicționare, egipteană, elvețiană, enciclopedie, engleză, evreiască, finlandeză, franceză, georgiană, germană, gramatică, greacă, indiană, irlandeză, istorie, italiană, japoneză, jurnal, latină, latino-americană, libaneză, literar, logică, maghiară, manual, monografie, norvegiană, olandeză, persană, peruană, poezie, poloneză, rusă, sanscrită, sârbă, spaniolă, studii, suedeză, turcă, ucraineană;

v Medicină, cu domeniile: anatomie, cardiologie, farmacologie, naturistă, alimentație și nutriție, medicină generală, neurologie, psihiatrie, medicină internă.